Investigadores AFOREST publican artículo sobre análisis del ADN mitocondrial del chañar
6 de septiembre de 2023

Los investigadores AFOREST Felipe Carevic y Roberto Contreras acaban de publicar el artículo Comparative analysis of the complete mitogenome of Geoffroea decorticans: a native tree surviving in the Atacama Desert. En esta publicación se abordan los resultados del análisis del ADN mitocondrial o mitogenoma del chañar, árbol que se encuentra en Chile entres las regiones de Tarapacá y Coquimbo.

El chañar (Geoffroea decorticans ha sido muy importante para los indígenas del desierto de Atacama desde hace más de 3.000 años.

A través de procesos evolutivos, el mitogenoma de G. decorticans probablemente se ha adaptado las condiciones extremas del desierto de Atacama. Aquí, comparamos el genoma mitocondrial de G. decorticans con los de otras especies de la familia Papilionoideae.

El mitogenoma de Chañar es relativamente compacto y tiene dos genes intactos (sdh4 y nad1) que no se observaron en la mayoría de las otras especies. Además, Chañar posee la mayor cantidad de ADN mitocondrial de origen plastidio entre las especies de angiospermas. El análisis filogenético de los mitogenomas de Chañar y de otros 12 taxones mostró un alto nivel de coherencia en la clasificación taxonómica, en comparación con los del genoma plastidial. Este estudio proporciona información valiosa sobre su capacidad para sobrevivir a las condiciones ambientales extremas del desierto de Atacama.

El análisis hilogenético realizado con los mitogenomas de Chañar y otros 12 taxones reveló un notable nivel de coherencia en la clasificación taxonómica. En comparación con otras especies de Papilionoideae, la estructura del mitogenoma de Geoffroea decorticans mostró cambios mínimos en términos de contenido génico, tamaño del genoma y genes funcionales. Sin embargo, es importante señalar que el mitogenoma de G. decorticans mostró reordenamientos distintos, reordenamientos, direccionalidad y organización en comparación Papilionoideae. Un aspecto notable es la conservación del ADN mitocondrial nativo en G. decorticans, como muestra la selección positiva para algunos genes durante la evolución. La retención de los genes sdh4, nad1 y nad4 intactos en G. decorticans sugiere que podrían ser importantes en los mecanismos de tolerancia a la sequía y, por tanto, en la capacidad de la especie para hacer frente a entornos áridos, ya que se han perdido en muchas plantas que crecen en condiciones más favorables.

Además, Chañar destaca por poseer la mayor cantidad de ADN mitocondrial de origen plastidial identificada en cualquier mitogenoma conocido hasta la fecha. Estos están implicados en la funcionalidad mitogenoma, y su abundancia en Chañar es probablemente el resultado de la adaptación evolutiva de la especie a las extremas condiciones extremas del desierto de Atacama. La adquisición de otros orgánulos, como los plastidios, a través de la transferencia horizontal de genes, dota al Chañar de un material genético único que potencialmente contribuye a sus estrategias de supervivencia. La combinación de genes conservados que facilitan las respuestas al estrés por sequía y la adquisición de material plastidial, han contribuido probablemente a las características excepcionales de G. decorticans. Esta especie no sólo sobrevive, sino que provee sustratos a los habitantes del desierto más árido de la Tierra, lo que la convierte en un ejemplo de entornos difíciles.

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